17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1969 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1969  PAP fibrillin  100 
 
 
212 aa  431  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.125177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3872  PAP fibrillin  68.75 
 
 
208 aa  295  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.688678  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0980  PAP fibrillin family protein  60.29 
 
 
214 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.215355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1513  PAP fibrillin family protein  58.53 
 
 
227 aa  245  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1485  PAP fibrillin family protein  58.06 
 
 
227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4591  PAP fibrillin  37.85 
 
 
194 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100062  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0467  PAP fibrillin family protein  40.59 
 
 
197 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1269  PAP fibrillin  35.26 
 
 
194 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0154  hypothetical protein  35.56 
 
 
205 aa  101  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.111648  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0700  PAP fibrillin family protein  34.91 
 
 
193 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1723  PAP fibrillin family protein  34.88 
 
 
197 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1747  PAP fibrillin family protein  34.3 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3892  PAP fibrillin family protein  32.56 
 
 
193 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29825  predicted protein  29.14 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48066  predicted protein  28.93 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.743882  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16899  predicted protein  33.63 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00359176  normal  0.0873946 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1028  hypothetical protein  26.97 
 
 
169 aa  42  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>