16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48066 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48066  predicted protein  100 
 
 
293 aa  599  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.743882  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0700  PAP fibrillin family protein  29.57 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1269  PAP fibrillin  29.57 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47358  predicted protein  27.9 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4591  PAP fibrillin  25.65 
 
 
194 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100062  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1747  PAP fibrillin family protein  27.23 
 
 
197 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3892  PAP fibrillin family protein  26.43 
 
 
193 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1723  PAP fibrillin family protein  28.07 
 
 
197 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16899  predicted protein  43.14 
 
 
190 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00359176  normal  0.0873946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0467  PAP fibrillin family protein  26.07 
 
 
197 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32872  predicted protein  30.43 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1969  PAP fibrillin  28.3 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.125177  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0154  hypothetical protein  27.12 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.111648  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0561  hypothetical protein  30.09 
 
 
157 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.690786  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12331  hypothetical protein  50 
 
 
187 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0980  PAP fibrillin family protein  29.66 
 
 
214 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.215355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>