28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1269 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1269  PAP fibrillin  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0700  PAP fibrillin family protein  79.79 
 
 
193 aa  315  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4591  PAP fibrillin  60.82 
 
 
194 aa  257  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100062  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1723  PAP fibrillin family protein  62.69 
 
 
197 aa  256  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1747  PAP fibrillin family protein  62.18 
 
 
197 aa  254  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3892  PAP fibrillin family protein  61.66 
 
 
193 aa  254  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0467  PAP fibrillin family protein  61.14 
 
 
197 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0154  hypothetical protein  44.79 
 
 
205 aa  173  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.111648  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3872  PAP fibrillin  36.84 
 
 
208 aa  111  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.688678  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0980  PAP fibrillin family protein  36.26 
 
 
214 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.215355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1969  PAP fibrillin  35.26 
 
 
212 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.125177  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29825  predicted protein  34.21 
 
 
242 aa  89.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1485  PAP fibrillin family protein  30 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1513  PAP fibrillin family protein  30.34 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48066  predicted protein  29.69 
 
 
293 aa  68.6  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.743882  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12331  hypothetical protein  32.64 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3166  hypothetical protein  24.68 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6312  predicted protein  34.29 
 
 
221 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0117429 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47358  predicted protein  29.26 
 
 
277 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_6260  predicted protein  34.29 
 
 
221 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.211759  hitchhiker  0.00528048 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1028  hypothetical protein  30.34 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333335  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16899  predicted protein  27.97 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00359176  normal  0.0873946 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13281  hypothetical protein  26.71 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.062463 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43886  predicted protein  25 
 
 
272 aa  45.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49943  predicted protein  44.68 
 
 
431 aa  45.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11101  hypothetical protein  31.4 
 
 
180 aa  44.7  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0561  hypothetical protein  26.35 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.690786  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11091  hypothetical protein  32.91 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.479652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>