17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0980 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0980  PAP fibrillin family protein  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.215355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1513  PAP fibrillin family protein  61.43 
 
 
227 aa  275  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1485  PAP fibrillin family protein  61.43 
 
 
227 aa  274  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1969  PAP fibrillin  60.29 
 
 
212 aa  262  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.125177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3872  PAP fibrillin  55.02 
 
 
208 aa  228  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.688678  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1269  PAP fibrillin  36.26 
 
 
194 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0700  PAP fibrillin family protein  34.62 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4591  PAP fibrillin  33.33 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100062  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1723  PAP fibrillin family protein  32.95 
 
 
197 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1747  PAP fibrillin family protein  32.37 
 
 
197 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0467  PAP fibrillin family protein  34.91 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0154  hypothetical protein  32.22 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.111648  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3892  PAP fibrillin family protein  30.17 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29825  predicted protein  30.29 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1028  hypothetical protein  29.35 
 
 
169 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333335  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48066  predicted protein  29.66 
 
 
293 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.743882  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16899  predicted protein  34.51 
 
 
190 aa  42.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00359176  normal  0.0873946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>