19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1485 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1513  PAP fibrillin family protein  99.56 
 
 
227 aa  454  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1485  PAP fibrillin family protein  100 
 
 
227 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0980  PAP fibrillin family protein  61.43 
 
 
214 aa  274  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.215355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1969  PAP fibrillin  58.06 
 
 
212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.125177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3872  PAP fibrillin  51.67 
 
 
208 aa  210  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.688678  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4591  PAP fibrillin  31.69 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100062  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0467  PAP fibrillin family protein  35 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1723  PAP fibrillin family protein  32.78 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1747  PAP fibrillin family protein  32.78 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1269  PAP fibrillin  30 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0700  PAP fibrillin family protein  31.01 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0154  hypothetical protein  30.56 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.111648  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3892  PAP fibrillin family protein  29.61 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29825  predicted protein  25.71 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1028  hypothetical protein  28.73 
 
 
169 aa  51.6  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12331  hypothetical protein  29.27 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11091  hypothetical protein  48.78 
 
 
180 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.479652  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32872  predicted protein  34.62 
 
 
266 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11101  hypothetical protein  47.5 
 
 
180 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>