250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0686 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_13101  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  75.84 
 
 
478 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13201  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  77.43 
 
 
479 aa  690    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.446015  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15931  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  79.83 
 
 
478 aa  662    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0753  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  79.83 
 
 
478 aa  661    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0686  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  100 
 
 
472 aa  931    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0782918  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1974  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  88.14 
 
 
473 aa  720    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.315931 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1242  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  77 
 
 
479 aa  728    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08621  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  83.82 
 
 
479 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12191  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  81.05 
 
 
477 aa  743    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.48318 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13351  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  77.38 
 
 
479 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.194535  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0662  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  52.25 
 
 
460 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0650  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.32 
 
 
460 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0123191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4703  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.21 
 
 
468 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00565562  normal  0.677094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3202  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.64 
 
 
475 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232806  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4267  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.17 
 
 
464 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3428  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.58 
 
 
467 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2894  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.79 
 
 
475 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0367  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50.43 
 
 
465 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.541099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2241  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.16 
 
 
468 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0680  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.01 
 
 
467 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2170  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.96 
 
 
486 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  47.19 
 
 
465 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.34 
 
 
464 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2988  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.82 
 
 
466 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.68 
 
 
467 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2798  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.6 
 
 
465 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.85456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.04 
 
 
472 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4040  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.92 
 
 
468 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10220  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  48.09 
 
 
462 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.437932  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6489  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.55 
 
 
464 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4578  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.37 
 
 
471 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  0.4459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3753  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.92 
 
 
471 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3142  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.76 
 
 
465 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583336  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1799  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.14 
 
 
455 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.287028  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3654  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.57 
 
 
461 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2804  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.83 
 
 
465 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2973  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.98 
 
 
462 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.719312  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05734  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.39 
 
 
464 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2761  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.71 
 
 
466 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.73 
 
 
484 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5018  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.94 
 
 
484 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03896  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  46.1 
 
 
449 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0997  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  47.57 
 
 
465 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0207  NAD(P) transhydrogenase beta subunit  45.82 
 
 
465 aa  372  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251626  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.42 
 
 
470 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3007  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.29 
 
 
464 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3966  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.8 
 
 
466 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155526  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1516  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.14 
 
 
455 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15909  normal  0.640123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.81 
 
 
462 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.81 
 
 
462 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1580  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.61 
 
 
462 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339018  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.16 
 
 
464 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000127  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  45.56 
 
 
458 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129759  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6364  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.91 
 
 
488 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1648  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.61 
 
 
462 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250723  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5290  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.91 
 
 
488 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5722  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.91 
 
 
489 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.81 
 
 
462 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1437  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.23 
 
 
467 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0958  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.08 
 
 
472 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368663  hitchhiker  0.000000193874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.16 
 
 
464 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1229  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.44 
 
 
466 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.81 
 
 
462 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2312  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.81 
 
 
462 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3106  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.63 
 
 
464 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1694  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.61 
 
 
462 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00431675  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.16 
 
 
464 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2120  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.61 
 
 
467 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228007  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1861  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.39 
 
 
462 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.885026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1589  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.61 
 
 
462 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.984324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.81 
 
 
462 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3207  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.63 
 
 
464 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.254389  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1676  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.81 
 
 
462 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.544393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01561  hypothetical protein  45.81 
 
 
462 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2060  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.47 
 
 
468 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258275 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1597  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.02 
 
 
462 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.240547  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1610  pyridine nucleotide transhydrogenase beta subunit  46.58 
 
 
470 aa  364  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.181074  normal  0.230255 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0371  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  44.14 
 
 
470 aa  363  3e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1850  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.14 
 
 
462 aa  363  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.513378  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.66 
 
 
469 aa  362  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1153  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.19 
 
 
459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0634538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.51 
 
 
481 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3540  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.87 
 
 
465 aa  362  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261084  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.01 
 
 
465 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0971  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.14 
 
 
466 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0634  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.74 
 
 
470 aa  361  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.282238  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0112  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.87 
 
 
477 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0545  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.33 
 
 
466 aa  360  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0911  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.14 
 
 
466 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.22 
 
 
478 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000848763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.22 
 
 
478 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69826  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.97 
 
 
482 aa  360  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.02 
 
 
484 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3350  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.51 
 
 
484 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3366  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.83 
 
 
464 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3384  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.51 
 
 
484 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5779  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.21 
 
 
470 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496694  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4747  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.4 
 
 
477 aa  360  4e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0557  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.44 
 
 
466 aa  359  5e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0972119  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5072  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.87 
 
 
476 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>