28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2516 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2516  hypothetical protein  100 
 
 
613 aa  1239    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.703675  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28341  hypothetical protein  43.45 
 
 
738 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0662  hypothetical protein  42.61 
 
 
304 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  58.06 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  38.46 
 
 
484 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  49.45 
 
 
489 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  41.67 
 
 
812 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26981  hypothetical protein  28.96 
 
 
326 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22831  hypothetical protein  28.4 
 
 
334 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27041  hypothetical protein  27.16 
 
 
357 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4840  hypothetical protein  51.79 
 
 
908 aa  53.9  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191443  hitchhiker  0.00180703 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27511  hypothetical protein  28.66 
 
 
338 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27491  hypothetical protein  25.93 
 
 
387 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  41.38 
 
 
1281 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  50.79 
 
 
926 aa  51.6  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  47.37 
 
 
928 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  66 
 
 
501 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  40.91 
 
 
268 aa  47.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  37.36 
 
 
1261 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  36.84 
 
 
555 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  39.71 
 
 
522 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  64.71 
 
 
223 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  34.92 
 
 
433 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  50.85 
 
 
630 aa  45.4  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4909  TfoX domain-containing protein  66.67 
 
 
219 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3457  TfoX-like  66.67 
 
 
219 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0944213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.55 
 
 
261 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  35.21 
 
 
489 aa  43.9  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>