22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1067 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0966  hypothetical protein  77.75 
 
 
457 aa  711    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173877  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1067  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  978    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0034  hypothetical protein  65.52 
 
 
469 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.907234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4361  hypothetical protein  63.38 
 
 
473 aa  601  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1676  hypothetical protein  61.54 
 
 
469 aa  588  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.729068 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06331  hypothetical protein  60.61 
 
 
430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.13594  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0409  hypothetical protein  54.7 
 
 
430 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.809492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11011  hypothetical protein  54.92 
 
 
430 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0193058 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1045  hypothetical protein  52.07 
 
 
404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1799  hypothetical protein  52.55 
 
 
451 aa  461  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07871  hypothetical protein  47.21 
 
 
439 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0459178  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0737  hypothetical protein  49.12 
 
 
439 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00875447  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07871  hypothetical protein  47.61 
 
 
439 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08551  hypothetical protein  47.68 
 
 
438 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.219552  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0756  hypothetical protein  49.01 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1000  hypothetical protein  47.79 
 
 
423 aa  403  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0413832  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0376  hypothetical protein  32.7 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0075  hypothetical protein  24.3 
 
 
424 aa  54.3  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2038  hypothetical protein  25.83 
 
 
424 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1240  hypothetical protein  24.07 
 
 
373 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0215  hypothetical protein  23.98 
 
 
426 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3782  hypothetical protein  24.38 
 
 
427 aa  43.5  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>