19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0215 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5031  hypothetical protein  81.54 
 
 		 429 aa  654    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0215  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  854    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2038  hypothetical protein  62.38 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0075  hypothetical protein  61.52 
 
 		 424 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3782  hypothetical protein  63.4 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3844  hypothetical protein  55.34 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1240  hypothetical protein  63.26 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3667  hypothetical protein  33.97 
 
 		 427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4622  hypothetical protein  32.93 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0984067  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0810  hypothetical protein  32.64 
 
 		 426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.450198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1732  hypothetical protein  33.41 
 
 		 412 aa  206  9e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0462  hypothetical protein  35.6 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0035  hypothetical protein  26.21 
 
 		 449 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0074  hypothetical protein  26.21 
 
 		 449 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.477349  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0050  hypothetical protein  25.61 
 
 		 449 aa  155  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1755  hypothetical protein  30.26 
 
 		 425 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1783  hypothetical protein  29.97 
 
 		 425 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1067  hypothetical protein  24.19 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4361  hypothetical protein  25.41 
 
 		 473 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>