30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3782 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2038  hypothetical protein  77.7 
 
 		 424 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3782  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  855    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0215  hypothetical protein  63.4 
 
 		 426 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0075  hypothetical protein  61.52 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5031  hypothetical protein  63.88 
 
 		 429 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3844  hypothetical protein  59.47 
 
 		 437 aa  478  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1240  hypothetical protein  61.73 
 
 		 373 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3667  hypothetical protein  35.77 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4622  hypothetical protein  34.77 
 
 		 427 aa  240  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0984067  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0810  hypothetical protein  33.81 
 
 		 426 aa  203  5e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.450198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1732  hypothetical protein  31.85 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0462  hypothetical protein  32.84 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0074  hypothetical protein  28.25 
 
 		 449 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.477349  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0035  hypothetical protein  28.25 
 
 		 449 aa  173  5e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0050  hypothetical protein  28.41 
 
 		 449 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1755  hypothetical protein  27.49 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1783  hypothetical protein  27.25 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4361  hypothetical protein  27.95 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0034  hypothetical protein  29.23 
 
 		 469 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.907234 
 
 
-
 
NC_002950  PG0756  hypothetical protein  23.96 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1067  hypothetical protein  25.75 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0966  hypothetical protein  25.84 
 
 		 457 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173877  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl427  chromosome segregation ATPase  20.27 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000465666  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1000  hypothetical protein  23.1 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0413832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1676  hypothetical protein  26.03 
 
 		 469 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.729068 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07871  hypothetical protein  25.25 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06331  hypothetical protein  26.4 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.13594  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11011  hypothetical protein  23.91 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0193058 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1045  hypothetical protein  24.61 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07871  hypothetical protein  22.13 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0459178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>