25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0075 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0075  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  848    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0215  hypothetical protein  61.52 
 
 		 426 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3782  hypothetical protein  61.52 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2038  hypothetical protein  58.87 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5031  hypothetical protein  60.1 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3844  hypothetical protein  59.19 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1240  hypothetical protein  61.32 
 
 		 373 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3667  hypothetical protein  37.27 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4622  hypothetical protein  34.61 
 
 		 427 aa  243  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0984067  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0810  hypothetical protein  32.86 
 
 		 426 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.450198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1732  hypothetical protein  32.08 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0462  hypothetical protein  37.76 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0050  hypothetical protein  27.21 
 
 		 449 aa  170  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0074  hypothetical protein  26.98 
 
 		 449 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.477349  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0035  hypothetical protein  26.98 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1755  hypothetical protein  28.19 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1783  hypothetical protein  27.95 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1067  hypothetical protein  24.25 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1676  hypothetical protein  24.95 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.729068 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0034  hypothetical protein  23.09 
 
 		 469 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.907234 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0966  hypothetical protein  24.94 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173877  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl427  chromosome segregation ATPase  24.09 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000465666  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0756  hypothetical protein  22.47 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  35.94 
 
 		 2196 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4361  hypothetical protein  26.68 
 
 		 473 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>