23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5031 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5031  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  856    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0215  hypothetical protein  81.54 
 
 		 426 aa  682    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2038  hypothetical protein  60.37 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0075  hypothetical protein  61.52 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3782  hypothetical protein  63.88 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1240  hypothetical protein  66.02 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3844  hypothetical protein  54.35 
 
 		 437 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3667  hypothetical protein  35.55 
 
 		 427 aa  250  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4622  hypothetical protein  33.89 
 
 		 427 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0984067  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1732  hypothetical protein  34.13 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0810  hypothetical protein  35.45 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.450198  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0462  hypothetical protein  34.5 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0050  hypothetical protein  26.56 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0074  hypothetical protein  27.38 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.477349  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0035  hypothetical protein  26.56 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1755  hypothetical protein  29.06 
 
 		 425 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1783  hypothetical protein  29.06 
 
 		 425 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl427  chromosome segregation ATPase  23.87 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000465666  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11011  hypothetical protein  23.42 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0193058 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0409  hypothetical protein  23.63 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.809492  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0756  hypothetical protein  23.57 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1067  hypothetical protein  24.31 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1799  hypothetical protein  23.96 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.41875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>