22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3844 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3844  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  878    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0075  hypothetical protein  59.19 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3782  hypothetical protein  59.47 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0215  hypothetical protein  55.34 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2038  hypothetical protein  57.45 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5031  hypothetical protein  54.35 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1240  hypothetical protein  59.07 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3667  hypothetical protein  35.96 
 
 		 427 aa  249  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4622  hypothetical protein  31.75 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0984067  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1732  hypothetical protein  32.87 
 
 		 412 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0810  hypothetical protein  29.98 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.450198  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0462  hypothetical protein  34.25 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1755  hypothetical protein  29.2 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1783  hypothetical protein  28.95 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0074  hypothetical protein  27.51 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.477349  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0035  hypothetical protein  27.38 
 
 		 449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0050  hypothetical protein  27.38 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1676  hypothetical protein  26.53 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.729068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4361  hypothetical protein  26.16 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1067  hypothetical protein  24.29 
 
 		 479 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0756  hypothetical protein  23.7 
 
 		 450 aa  43.9  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1261  hypothetical protein  26.64 
 
 		 448 aa  43.1  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.263937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>