17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1045 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1045  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  809    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0034  hypothetical protein  56.21 
 
 
469 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.907234 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1067  hypothetical protein  54.25 
 
 
479 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1799  hypothetical protein  55.13 
 
 
451 aa  480  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06331  hypothetical protein  54.02 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.13594  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0966  hypothetical protein  52.75 
 
 
457 aa  457  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173877  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0409  hypothetical protein  53.04 
 
 
430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.809492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11011  hypothetical protein  52.45 
 
 
430 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0193058 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4361  hypothetical protein  60.42 
 
 
473 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1676  hypothetical protein  49.23 
 
 
469 aa  441  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.729068 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07871  hypothetical protein  48.74 
 
 
439 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07871  hypothetical protein  48.28 
 
 
439 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0459178  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0737  hypothetical protein  47.36 
 
 
439 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00875447  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0756  hypothetical protein  46.43 
 
 
450 aa  380  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08551  hypothetical protein  46.33 
 
 
438 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.219552  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1000  hypothetical protein  47.29 
 
 
423 aa  376  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0413832  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0376  hypothetical protein  33 
 
 
505 aa  82.8  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>