16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4896 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4896  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  781    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.312197 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5867  hypothetical protein  37.08 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2040  hypothetical protein  36.07 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3260  hypothetical protein  30.87 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0706269  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4582  hypothetical protein  32.16 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1099  hypothetical protein  32 
 
 		 436 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0749  hypothetical protein  31.29 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000166658 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0139  hypothetical protein  26.67 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000487885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1402  hypothetical protein  23.21 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2742  hypothetical protein  23.21 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.732041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2906  hypothetical protein  28.43 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2756  hypothetical protein  22.46 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3169  hypothetical protein  26.09 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5253  hypothetical protein  27.06 
 
 		 435 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.927267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0150  hypothetical protein  22.79 
 
 		 443 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.369898 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3031  hypothetical protein  24.69 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>