14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2906 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2906  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  811    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0749  hypothetical protein  30.9 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000166658 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5867  hypothetical protein  25.44 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4896  hypothetical protein  28.43 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.312197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3260  hypothetical protein  27.74 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0706269  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2040  hypothetical protein  27.56 
 
 		 441 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1099  hypothetical protein  24.65 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4582  hypothetical protein  24.37 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1402  hypothetical protein  24.8 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3031  hypothetical protein  26.16 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2742  hypothetical protein  24.8 
 
 		 404 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.732041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0150  hypothetical protein  22.45 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.369898 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5253  hypothetical protein  25.99 
 
 		 435 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.927267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2756  hypothetical protein  23.27 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>