11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1402 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2742  hypothetical protein  98.51 
 
 		 404 aa  821    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.732041  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  827    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2040  hypothetical protein  30.21 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5867  hypothetical protein  27.96 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4582  hypothetical protein  26.15 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4896  hypothetical protein  23.21 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.312197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1099  hypothetical protein  27.86 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0749  hypothetical protein  25.7 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000166658 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0139  hypothetical protein  20.64 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000487885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3260  hypothetical protein  28.04 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0706269  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2906  hypothetical protein  24.8 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>