11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2742 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2742  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  827    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.732041  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1402  hypothetical protein  98.51 
 
 		 404 aa  821    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2040  hypothetical protein  29.86 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5867  hypothetical protein  27.24 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4582  hypothetical protein  25.8 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4896  hypothetical protein  23.21 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.312197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1099  hypothetical protein  27.48 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0749  hypothetical protein  26.51 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000166658 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0139  hypothetical protein  20.64 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000487885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3260  hypothetical protein  28.04 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0706269  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2906  hypothetical protein  24.8 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>