15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5867 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5867  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  827    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4582  hypothetical protein  40.92 
 
 
395 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3260  hypothetical protein  37.09 
 
 
431 aa  243  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0706269  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4896  hypothetical protein  37.08 
 
 
380 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.312197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2040  hypothetical protein  34.46 
 
 
441 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1099  hypothetical protein  36.45 
 
 
436 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0139  hypothetical protein  30.45 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000487885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0749  hypothetical protein  29.55 
 
 
368 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000166658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2756  hypothetical protein  29.06 
 
 
407 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1402  hypothetical protein  27.96 
 
 
404 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2742  hypothetical protein  27.24 
 
 
404 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.732041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2906  hypothetical protein  25.44 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5253  hypothetical protein  23.94 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.927267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0150  hypothetical protein  24.27 
 
 
443 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.369898 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3169  hypothetical protein  33.33 
 
 
429 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.335832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>