16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2040 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2040  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  895    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4896  hypothetical protein  36.07 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.312197 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5867  hypothetical protein  34.46 
 
 		 397 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4582  hypothetical protein  30.51 
 
 		 395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3260  hypothetical protein  33.15 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0706269  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1099  hypothetical protein  34.82 
 
 		 436 aa  156  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  123  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000166658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1402  hypothetical protein  30.21 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2742  hypothetical protein  29.86 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.732041  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0139  hypothetical protein  25.99 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000487885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2906  hypothetical protein  27.56 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2756  hypothetical protein  25.76 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0150  hypothetical protein  22.01 
 
 		 443 aa  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.369898 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3169  hypothetical protein  26.81 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5253  hypothetical protein  25.94 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.927267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3031  hypothetical protein  30.69 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>