15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3260 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3260  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  860    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0706269  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5867  hypothetical protein  37.09 
 
 
397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4896  hypothetical protein  30.87 
 
 
380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.312197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4582  hypothetical protein  30.77 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1099  hypothetical protein  34.38 
 
 
436 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2040  hypothetical protein  33.15 
 
 
441 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0749  hypothetical protein  31.78 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000166658 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0139  hypothetical protein  23.13 
 
 
428 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000487885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2906  hypothetical protein  27.74 
 
 
392 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2742  hypothetical protein  28.04 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.732041  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1402  hypothetical protein  28.04 
 
 
404 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2756  hypothetical protein  25.24 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5253  hypothetical protein  24.57 
 
 
435 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.927267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3031  hypothetical protein  27.54 
 
 
443 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0150  hypothetical protein  25.57 
 
 
443 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.369898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>