14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1099 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1099  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  872    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5867  hypothetical protein  36.45 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3260  hypothetical protein  34.38 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0706269  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4896  hypothetical protein  32 
 
 		 380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.312197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2040  hypothetical protein  34.82 
 
 		 441 aa  146  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4582  hypothetical protein  28.62 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0749  hypothetical protein  33.09 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000166658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1402  hypothetical protein  27.86 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2742  hypothetical protein  27.48 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.732041  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0139  hypothetical protein  19.71 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000487885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2906  hypothetical protein  24.65 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2756  hypothetical protein  22.91 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  32.86 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  36.21 
 
 		 224 aa  43.1  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>