23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3444 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1571  hypothetical protein  78.58 
 
 		 1041 aa  1738    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2969  hypothetical protein  77.71 
 
 		 1040 aa  1719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0428222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3444  hypothetical protein  100 
 
 		 1040 aa  2164    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1413  hypothetical protein  77.62 
 
 		 1040 aa  1721    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2699  hypothetical protein  77.62 
 
 		 1041 aa  1722    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000707036 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2767  hypothetical protein  77.91 
 
 		 1041 aa  1726    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2869  hypothetical protein  78 
 
 		 1041 aa  1732    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1582  hypothetical protein  81.77 
 
 		 1051 aa  1808    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1374  hypothetical protein  77.71 
 
 		 1040 aa  1722    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1390  hypothetical protein  77.71 
 
 		 1040 aa  1719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0082  hypothetical protein  37.93 
 
 		 769 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00502388  hitchhiker  0.00904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0081  hypothetical protein  25.37 
 
 		 415 aa  90.1  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.203435  normal  0.0152048 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  42.17 
 
 		 486 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  40.96 
 
 		 486 aa  52.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  34.15 
 
 		 499 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 		 484 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  37.66 
 
 		 478 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  37.35 
 
 		 488 aa  45.8  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  33.33 
 
 		 508 aa  45.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  32.5 
 
 		 484 aa  45.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  38.55 
 
 		 488 aa  45.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  40.26 
 
 		 484 aa  45.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  40.32 
 
 		 670 aa  44.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>