21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1390 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1571  hypothetical protein  90.58 
 
 		 1041 aa  1994    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2969  hypothetical protein  99.23 
 
 		 1040 aa  2154    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0428222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3444  hypothetical protein  77.71 
 
 		 1040 aa  1719    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1413  hypothetical protein  97.88 
 
 		 1040 aa  2127    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2699  hypothetical protein  91.35 
 
 		 1041 aa  2003    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000707036 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2767  hypothetical protein  91.06 
 
 		 1041 aa  1996    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2869  hypothetical protein  91.35 
 
 		 1041 aa  2006    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1390  hypothetical protein  100 
 
 		 1040 aa  2167    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1582  hypothetical protein  75.83 
 
 		 1051 aa  1677    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1374  hypothetical protein  98.27 
 
 		 1040 aa  2133    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0082  hypothetical protein  36.39 
 
 		 769 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00502388  hitchhiker  0.00904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0081  hypothetical protein  26.57 
 
 		 415 aa  97.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.203435  normal  0.0152048 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  43.37 
 
 		 486 aa  53.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  42.17 
 
 		 486 aa  51.6  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  41.77 
 
 		 499 aa  48.9  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  32.82 
 
 		 624 aa  48.5  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  39.76 
 
 		 488 aa  47.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  39.76 
 
 		 488 aa  47.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  40.79 
 
 		 484 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  38.16 
 
 		 478 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  38.55 
 
 		 482 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>