17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2699 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1571  hypothetical protein  93.66 
 
 		 1041 aa  2063    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2969  hypothetical protein  91.63 
 
 		 1040 aa  2008    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0428222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3444  hypothetical protein  77.62 
 
 		 1040 aa  1722    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2699  hypothetical protein  100 
 
 		 1041 aa  2171    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000707036 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2767  hypothetical protein  98.85 
 
 		 1041 aa  2151    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2869  hypothetical protein  98.37 
 
 		 1041 aa  2144    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1390  hypothetical protein  91.35 
 
 		 1040 aa  2003    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1374  hypothetical protein  91.35 
 
 		 1040 aa  2006    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1582  hypothetical protein  76.31 
 
 		 1051 aa  1694    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1413  hypothetical protein  91.35 
 
 		 1040 aa  2003    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0082  hypothetical protein  36.99 
 
 		 769 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00502388  hitchhiker  0.00904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0081  hypothetical protein  26.87 
 
 		 415 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.203435  normal  0.0152048 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  42.17 
 
 		 486 aa  50.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  40.96 
 
 		 486 aa  48.5  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  32.82 
 
 		 624 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  40.51 
 
 		 499 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  38.55 
 
 		 488 aa  44.7  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>