18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0123 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0123  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  533  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0144  hypothetical protein  71.71 
 
 
258 aa  394  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.094996  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4066  hypothetical protein  63.98 
 
 
291 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2813  hypothetical protein  60.85 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.674716  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3658  hypothetical protein  58.1 
 
 
258 aa  317  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4700  hypothetical protein  52.33 
 
 
262 aa  295  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4052  hypothetical protein  61.43 
 
 
262 aa  285  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3875  hypothetical protein  56.19 
 
 
259 aa  278  9e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3843  hypothetical protein  50.39 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3936  hypothetical protein  50 
 
 
278 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4393  hypothetical protein  55.41 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4218  hypothetical protein  54.75 
 
 
263 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0123  hypothetical protein  57.14 
 
 
263 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4257  hypothetical protein  54.75 
 
 
263 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3545  hypothetical protein  53.64 
 
 
230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0086  hypothetical protein  58.12 
 
 
232 aa  248  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3594  hypothetical protein  50.45 
 
 
246 aa  240  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0829  hypothetical protein  21.57 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.263305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>