18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4052 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_4052  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4700  hypothetical protein  85.5 
 
 
262 aa  474  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3843  hypothetical protein  82.76 
 
 
278 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3936  hypothetical protein  81.61 
 
 
278 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4393  hypothetical protein  68.73 
 
 
263 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4257  hypothetical protein  67.57 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4218  hypothetical protein  67.18 
 
 
263 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0123  hypothetical protein  67.18 
 
 
263 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0086  hypothetical protein  70.67 
 
 
232 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4066  hypothetical protein  54.47 
 
 
291 aa  292  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0123  hypothetical protein  61.43 
 
 
258 aa  284  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0144  hypothetical protein  54.62 
 
 
258 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.094996  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3658  hypothetical protein  61.61 
 
 
258 aa  267  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3875  hypothetical protein  53.74 
 
 
259 aa  262  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3545  hypothetical protein  56.83 
 
 
230 aa  257  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2813  hypothetical protein  52.97 
 
 
253 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.674716  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3594  hypothetical protein  49.79 
 
 
246 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0829  hypothetical protein  24.58 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.263305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>