18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0144 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0144  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.094996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0123  hypothetical protein  71.71 
 
 		 258 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4066  hypothetical protein  64.37 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3658  hypothetical protein  59.62 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2813  hypothetical protein  56.5 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.674716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3875  hypothetical protein  60 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4700  hypothetical protein  54.22 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4052  hypothetical protein  61.43 
 
 		 262 aa  278  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3843  hypothetical protein  53.31 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3936  hypothetical protein  52.34 
 
 		 278 aa  272  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4393  hypothetical protein  54.05 
 
 		 263 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4218  hypothetical protein  53.6 
 
 		 263 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0123  hypothetical protein  56.19 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4257  hypothetical protein  53.6 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3545  hypothetical protein  54.05 
 
 		 230 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0086  hypothetical protein  50.93 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3594  hypothetical protein  50.22 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0829  hypothetical protein  24.76 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.263305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>