18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3843 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3843  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3936  hypothetical protein  98.2 
 
 		 278 aa  564  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4052  hypothetical protein  81.61 
 
 		 262 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4700  hypothetical protein  76.72 
 
 		 262 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4393  hypothetical protein  69.29 
 
 		 263 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4257  hypothetical protein  68.9 
 
 		 263 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4218  hypothetical protein  68.5 
 
 		 263 aa  347  9e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0123  hypothetical protein  68.5 
 
 		 263 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0086  hypothetical protein  65.62 
 
 		 232 aa  308  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0144  hypothetical protein  53.31 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.094996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4066  hypothetical protein  60.48 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3875  hypothetical protein  55.31 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0123  hypothetical protein  56.36 
 
 		 258 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3658  hypothetical protein  58.77 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3545  hypothetical protein  55.66 
 
 		 230 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2813  hypothetical protein  51.49 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.674716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3594  hypothetical protein  50.23 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0829  hypothetical protein  21.32 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.263305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>