18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3545 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3545  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4700  hypothetical protein  56.83 
 
 		 262 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4052  hypothetical protein  59.05 
 
 		 262 aa  254  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0123  hypothetical protein  53.64 
 
 		 258 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3843  hypothetical protein  55.66 
 
 		 278 aa  251  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4066  hypothetical protein  55.24 
 
 		 291 aa  251  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3936  hypothetical protein  54.75 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3658  hypothetical protein  55.29 
 
 		 258 aa  244  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0144  hypothetical protein  54.05 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.094996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0123  hypothetical protein  54.29 
 
 		 263 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4257  hypothetical protein  54.29 
 
 		 263 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4218  hypothetical protein  54.76 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4393  hypothetical protein  53.81 
 
 		 263 aa  234  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3875  hypothetical protein  46.84 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0086  hypothetical protein  53.3 
 
 		 232 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3594  hypothetical protein  46.69 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2813  hypothetical protein  46.01 
 
 		 253 aa  214  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.674716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0829  hypothetical protein  23.85 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.263305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>