17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3875 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3875  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  541  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0144  hypothetical protein  60 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.094996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0123  hypothetical protein  56.19 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4066  hypothetical protein  57.62 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3843  hypothetical protein  55.31 
 
 		 278 aa  274  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3936  hypothetical protein  53.98 
 
 		 278 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4700  hypothetical protein  53.1 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4052  hypothetical protein  55.24 
 
 		 262 aa  258  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3658  hypothetical protein  52.38 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4393  hypothetical protein  52.86 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0123  hypothetical protein  51.43 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4257  hypothetical protein  51.43 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4218  hypothetical protein  50.48 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2813  hypothetical protein  45.23 
 
 		 253 aa  235  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.674716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3545  hypothetical protein  46.84 
 
 		 230 aa  228  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0086  hypothetical protein  52.22 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3594  hypothetical protein  46.38 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>