18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2813 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2813  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.674716  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0123  hypothetical protein  60.85 
 
 
258 aa  330  9e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0144  hypothetical protein  56.5 
 
 
258 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.094996  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4066  hypothetical protein  52.96 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3658  hypothetical protein  53.12 
 
 
258 aa  271  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4218  hypothetical protein  51.12 
 
 
263 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0123  hypothetical protein  52.4 
 
 
263 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4700  hypothetical protein  52.48 
 
 
262 aa  236  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3875  hypothetical protein  45.23 
 
 
259 aa  235  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4393  hypothetical protein  51.44 
 
 
263 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4052  hypothetical protein  51.92 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4257  hypothetical protein  51.92 
 
 
263 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3936  hypothetical protein  51.49 
 
 
278 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3843  hypothetical protein  51.49 
 
 
278 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0086  hypothetical protein  55.06 
 
 
232 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3545  hypothetical protein  46.01 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3594  hypothetical protein  45.89 
 
 
246 aa  202  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0829  hypothetical protein  22.04 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.263305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>