34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0153 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0153  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 89 aa  187  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.924925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  59.46 
 
 		 440 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  47.56 
 
 		 420 aa  79.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  50 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  53.52 
 
 		 414 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  53.52 
 
 		 414 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  53.03 
 
 		 444 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  50.75 
 
 		 421 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  43.55 
 
 		 432 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  45.1 
 
 		 444 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  42.62 
 
 		 434 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  42.37 
 
 		 434 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  42.31 
 
 		 431 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  39.39 
 
 		 384 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  42.19 
 
 		 429 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  40 
 
 		 412 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  64.52 
 
 		 425 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  64.52 
 
 		 425 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  64.52 
 
 		 425 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  51.35 
 
 		 416 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  29.69 
 
 		 436 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  44.44 
 
 		 404 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  51.28 
 
 		 434 aa  43.5  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  54.29 
 
 		 445 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  54.29 
 
 		 445 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  47.83 
 
 		 434 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  36.07 
 
 		 413 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  42.11 
 
 		 524 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  36.07 
 
 		 413 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  36.07 
 
 		 413 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  29.09 
 
 		 409 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  45.95 
 
 		 411 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2495  phage portal protein, HK97 family  36.07 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0490776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  37.1 
 
 		 401 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>