24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0137 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0137  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  184  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  65 
 
 		 372 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  36.92 
 
 		 781 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  32.91 
 
 		 383 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  31.71 
 
 		 758 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.06 
 
 		 431 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  32.89 
 
 		 741 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  28.38 
 
 		 291 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  27.27 
 
 		 414 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  33.82 
 
 		 282 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  29.79 
 
 		 589 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  35.06 
 
 		 343 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  20.99 
 
 		 450 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  22.67 
 
 		 447 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  27.63 
 
 		 652 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  38.33 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  27.85 
 
 		 549 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  35.85 
 
 		 323 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  35.06 
 
 		 763 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.34 
 
 		 657 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  28.24 
 
 		 276 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  26.25 
 
 		 450 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  25.97 
 
 		 792 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  25.97 
 
 		 591 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>