242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4697 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4697  arsenate reductase  100 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3279  arsenate reductase  60.53 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107432  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1826  arsenate reductase  53.51 
 
 		 114 aa  115  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.209582  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1977  arsenate reductase  50.86 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224843  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  53.45 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4784  arsenate reductase  52.63 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.375449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  49.57 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  49.57 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  49.57 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4629  arsenate reductase  51.79 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12717  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4250  arsenate reductase  51.79 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4336  arsenate reductase  51.79 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0780089  normal  0.281607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0876  arsenate reductase  50 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  48.28 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  49.12 
 
 		 113 aa  99.4  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  46.55 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  46.55 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  49.11 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1542  arsenate reductase  48.25 
 
 		 113 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1379  arsenate reductase  47.41 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  46.55 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2539  arsenate reductase  50 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.220394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  46.9 
 
 		 117 aa  97.1  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  46.55 
 
 		 116 aa  96.7  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0302  arsenate reductase  47.86 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  46.96 
 
 		 116 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  46.96 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  44.83 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  46.09 
 
 		 122 aa  95.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  44.35 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  46.09 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  47.01 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  46.55 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  46.09 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1910  arsenate reductase  50 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  44.83 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  45.69 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  43.1 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3191  arsenate reductase  45.45 
 
 		 118 aa  94.4  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  45.22 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1971  arsenate reductase  43.97 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  45.69 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  48.28 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  48.28 
 
 		 141 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  50.43 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  46.09 
 
 		 118 aa  94.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  45.22 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  44.07 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  45.61 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  46.09 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  45.69 
 
 		 136 aa  93.6  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  44.83 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  43.97 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  47.41 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  47.41 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  44.92 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  47.41 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  47.41 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  47.41 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  47.79 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  47.41 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  47.41 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3966  arsenate reductase  48.25 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.662339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  44.83 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3103  arsenate reductase  44.07 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  43.97 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4964  arsenate reductase  46.61 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000180468  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5723  arsenate reductase  44.83 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  47.41 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3865  arsenate reductase  48.31 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  44.74 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  43.97 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  49.57 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  46.55 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3271  arsenate reductase  44.83 
 
 		 119 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5683  arsenate reductase  44.83 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1852  arsenate reductase  43.36 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  46.09 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3436  arsenate reductase  43.1 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  43.59 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1525  arsenate reductase  43.97 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.085223  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  43.22 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  43.59 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2418  arsenate reductase  42.74 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  43.36 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2243  arsenate reductase  43.86 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  47.41 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  47.79 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1942  arsenate reductase  53.57 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  44.64 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  42.24 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2244  arsenate reductase  44.83 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134877  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  44.83 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2534  arsenate reductase  43.1 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  46.43 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0225096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>