222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1826 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1826  arsenate reductase  100 
 
 
114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.209582  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3279  arsenate reductase  66.96 
 
 
113 aa  152  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4697  arsenate reductase  53.51 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329407  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  51.72 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1525  arsenate reductase  51.72 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.085223  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  51.33 
 
 
141 aa  107  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  50.86 
 
 
140 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1977  arsenate reductase  49.14 
 
 
139 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224843  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  49.14 
 
 
141 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  47.41 
 
 
140 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  49.14 
 
 
140 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  48.28 
 
 
317 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  49.57 
 
 
113 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2418  arsenate reductase  49.14 
 
 
142 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  50 
 
 
141 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5723  arsenate reductase  50 
 
 
141 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5683  arsenate reductase  50 
 
 
141 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  48.28 
 
 
142 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  44.83 
 
 
162 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  48.28 
 
 
140 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  49.56 
 
 
276 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0876  arsenate reductase  49.14 
 
 
145 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  47.41 
 
 
141 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0302  arsenate reductase  49.14 
 
 
140 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336269  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2539  arsenate reductase  50.89 
 
 
143 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.220394  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1971  arsenate reductase  47.41 
 
 
146 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322501  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  51.33 
 
 
145 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2198  arsenate reductase  46.55 
 
 
137 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3966  arsenate reductase  50.44 
 
 
144 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.662339 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  49.14 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1379  arsenate reductase  48.25 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4662  arsenate reductase  49.14 
 
 
134 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246432  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3865  arsenate reductase  49.12 
 
 
145 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  46.55 
 
 
134 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1542  arsenate reductase  47.37 
 
 
113 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  47.01 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  49.12 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2271  arsenate reductase  48.21 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  47.41 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4072  arsenate reductase  48.28 
 
 
141 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124746  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  47.41 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  46.9 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  47.41 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2244  arsenate reductase  45.69 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  45.69 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  45.69 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  44.83 
 
 
141 aa  95.9  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  45.61 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2534  arsenate reductase  47.86 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4784  arsenate reductase  46.49 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.375449  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0957  arsenate reductase  43.97 
 
 
115 aa  93.6  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1961  arsenate reductase  47.79 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0491  arsenate reductase  47.37 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  45.69 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  45.69 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  44.83 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  44.83 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1910  arsenate reductase  46.15 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5710  arsenate reductase  45.13 
 
 
140 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0989  arsenate reductase ArsC, putative  43.1 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  46.55 
 
 
139 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  43.7 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2243  arsenate reductase  43.36 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  45.22 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4250  arsenate reductase  46.43 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4336  arsenate reductase  46.43 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0780089  normal  0.281607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4629  arsenate reductase  46.43 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12717  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1283  arsenate reductase  45.13 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.884735  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30670  arsenate reductase  44.25 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0647  arsenate reductase  45.13 
 
 
140 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  43.48 
 
 
143 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  42.48 
 
 
143 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6300  arsenate reductase  44.25 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.743402  normal  0.39419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  44.25 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  44.83 
 
 
116 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2315  arsenate reductase  43.36 
 
 
140 aa  87  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.509444  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  45.13 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  41.38 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  42.24 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1942  arsenate reductase  48.21 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6564  arsenate reductase  44.25 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4852  arsenate reductase  43.36 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3830  arsenate reductase  44.64 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.720829  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5671  arsenate reductase  43.86 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229186  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2345  arsenate reductase  44.64 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  hitchhiker  0.00279499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2288  arsenate reductase  47.79 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  hitchhiker  0.00391371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  43.36 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0211  arsenate reductase  43.36 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3705  arsenate reductase  43.36 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.556229  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3127  putative arsenate reductase  46.02 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3818  arsenate reductase  43.36 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  43.36 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03305  hypothetical protein  43.36 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3986  arsenate reductase  43.36 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3857  arsenate reductase  46.9 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2798  arsenate reductase and related  43.59 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1214  arsenate reductase  42.86 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0590  arsenate reductase and related  45.69 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0605  arsenate reductase and related  45.69 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.756451  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1852  arsenate reductase  39.82 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>