78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3721 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3721  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2479  hypothetical protein  71.64 
 
 		 67 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2288  hypothetical protein  67.16 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3724  hypothetical protein  67.16 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0417243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4202  hypothetical protein  64.18 
 
 		 67 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4698  hypothetical protein  62.12 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0244  hypothetical protein  63.08 
 
 		 68 aa  88.2  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.373808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4303  hypothetical protein  62.69 
 
 		 67 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0993  hypothetical protein  53.73 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.984074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1210  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  65.15 
 
 		 66 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0883  hypothetical protein  59.7 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0589  hypothetical protein  61.19 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.815479  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2242  hypothetical protein  61.19 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.373978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1105  hypothetical protein  61.19 
 
 		 67 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0969  hypothetical protein  56.72 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0106427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1351  hypothetical protein  56.72 
 
 		 67 aa  78.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00580499  hitchhiker  0.000123196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1672  hypothetical protein  50.75 
 
 		 67 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.495158  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3224  hypothetical protein  55.22 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  58.21 
 
 		 256 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1300  hypothetical protein  54.55 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.570889  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0994  hypothetical protein  50.75 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1388  hypothetical protein  52.24 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.801628  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1091  hypothetical protein  53.73 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00223092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2871  hypothetical protein  56.45 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.061034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1582  hypothetical protein  56.45 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00572873  hitchhiker  0.000000000892194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2796  hypothetical protein  56.45 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000387625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2776  hypothetical protein  56.45 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2690  hypothetical protein  55.74 
 
 		 70 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1127  hypothetical protein  56.72 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.222198  normal  0.339922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2183  hypothetical protein  57.38 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00725141  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2475  hypothetical protein  54.84 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250816  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1445  hypothetical protein  56.45 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000274385  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3104  hypothetical protein  56.45 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0208  rhodanese-related sulfurtransferase  50.75 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1392  hypothetical protein  56.45 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  hitchhiker  0.000000000223509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0492  hypothetical protein  61.19 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119962  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1457  hypothetical protein  56.45 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000515055  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1168  hypothetical protein  49.25 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0485265  normal  0.126303 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2441  hypothetical protein  50.82 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1346  hypothetical protein  50.75 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0587  hypothetical protein  52.46 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2612  hypothetical protein  45.16 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.263464  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000100  hypothetical protein  49.18 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136793  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3630  hypothetical protein  49.18 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1736  hypothetical protein  49.15 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00537203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1458  hypothetical protein  47.46 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1613  hypothetical protein  54.1 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0675428  hitchhiker  0.00154974 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2179  hypothetical protein  48.44 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000190781  hitchhiker  0.00000346737 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1175  hypothetical protein  38.81 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1411  hypothetical protein  44.26 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158578  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3564  hypothetical protein  41.18 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0710872  normal  0.0244929 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2741  hypothetical protein  44.26 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3758  hypothetical protein  38.46 
 
 		 74 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3342  hypothetical protein  36.36 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00840593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1237  hypothetical protein  36.92 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3851  hypothetical protein  37.88 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3849  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3933  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2350  hypothetical protein  41.79 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3768  hypothetical protein  37.88 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3711  hypothetical protein  39.39 
 
 		 76 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3301  thiosulfate sulfurtransferase  37.14 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.967077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0396  hypothetical protein  38.33 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191908  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  40.98 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3124  hypothetical protein  36.67 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3464  hypothetical protein  35 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000141728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4226  hypothetical protein  38.33 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3745  hypothetical protein  36.92 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  39.66 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2829  hypothetical protein  35.94 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00164187  hitchhiker  0.00166345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  50 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  46.94 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  38.18 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2398  hypothetical protein  34.78 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0057  hypothetical protein  32.35 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1998  hypothetical protein  37.14 
 
 		 73 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2365  hypothetical protein  37.14 
 
 		 73 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  46.67 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>