71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2365 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2365  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1998  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3342  hypothetical protein  63.01 
 
 		 75 aa  90.5  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00840593 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3758  hypothetical protein  57.35 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626743  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2829  hypothetical protein  59.09 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00164187  hitchhiker  0.00166345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3745  hypothetical protein  55.41 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0057  hypothetical protein  47.76 
 
 		 69 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3564  hypothetical protein  59.15 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0710872  normal  0.0244929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3301  thiosulfate sulfurtransferase  54.79 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.967077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3711  hypothetical protein  54.41 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3768  hypothetical protein  50.72 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3851  hypothetical protein  50.72 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209751  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2398  hypothetical protein  54.79 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4698  hypothetical protein  54.41 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3933  hypothetical protein  48.48 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2350  hypothetical protein  46.97 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2690  hypothetical protein  49.28 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1445  hypothetical protein  46.58 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000274385  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1672  hypothetical protein  48.57 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.495158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4226  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0396  hypothetical protein  44 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3464  hypothetical protein  53.03 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000141728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3849  hypothetical protein  47.69 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1458  hypothetical protein  48.44 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2871  hypothetical protein  43.84 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.061034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2776  hypothetical protein  43.84 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1582  hypothetical protein  43.84 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00572873  hitchhiker  0.000000000892194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3124  hypothetical protein  48.48 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0993  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.984074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2796  hypothetical protein  43.84 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000387625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1392  hypothetical protein  43.84 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  hitchhiker  0.000000000223509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1457  hypothetical protein  43.84 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000515055  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1736  hypothetical protein  48.48 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00537203 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1388  hypothetical protein  48.53 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.801628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2612  hypothetical protein  42.03 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.263464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3104  hypothetical protein  42.47 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2475  hypothetical protein  42.47 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250816  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1127  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.222198  normal  0.339922 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1300  hypothetical protein  47.22 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.570889  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1346  hypothetical protein  47.14 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2479  hypothetical protein  42.65 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2441  hypothetical protein  39.73 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2288  hypothetical protein  42.86 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0883  hypothetical protein  48.48 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1351  hypothetical protein  47.14 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00580499  hitchhiker  0.000123196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2183  hypothetical protein  43.48 
 
 		 71 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00725141  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4202  hypothetical protein  41.43 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0969  hypothetical protein  45.71 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0106427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1105  hypothetical protein  44.12 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0587  hypothetical protein  50.77 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0994  hypothetical protein  42.03 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2179  hypothetical protein  43.06 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000190781  hitchhiker  0.00000346737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1411  hypothetical protein  39.68 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158578  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000100  hypothetical protein  45.31 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136793  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1210  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  40 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2741  hypothetical protein  43.75 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2242  hypothetical protein  52.73 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.373978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0589  hypothetical protein  52.73 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.815479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1091  hypothetical protein  41.43 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00223092  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1168  hypothetical protein  41.43 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0485265  normal  0.126303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3630  hypothetical protein  46.88 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0208  rhodanese-related sulfurtransferase  38.57 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3724  hypothetical protein  41.43 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0417243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4303  hypothetical protein  38.57 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0244  hypothetical protein  40.91 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.373808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  44.07 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1366  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.75 
 
 		 738 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  42.37 
 
 		 177 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1175  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1237  hypothetical protein  35.71 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>