74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2479 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2479  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  132  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573708  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4698  hypothetical protein  63.64 
 
 
66 aa  93.6  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2288  hypothetical protein  61.19 
 
 
67 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4202  hypothetical protein  67.16 
 
 
67 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46747  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3721  hypothetical protein  71.64 
 
 
67 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579125  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4303  hypothetical protein  65.67 
 
 
67 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0993  hypothetical protein  61.19 
 
 
67 aa  87.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.984074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1105  hypothetical protein  59.7 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1210  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  63.64 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3724  hypothetical protein  61.19 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0417243  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1672  hypothetical protein  53.73 
 
 
67 aa  83.6  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.495158  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1388  hypothetical protein  55.22 
 
 
67 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.801628  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1127  hypothetical protein  61.19 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.222198  normal  0.339922 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2242  hypothetical protein  50.75 
 
 
67 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.373978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  57.58 
 
 
256 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0589  hypothetical protein  50.75 
 
 
67 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.815479  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3224  hypothetical protein  58.21 
 
 
67 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719381  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1300  hypothetical protein  56.06 
 
 
67 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.570889  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0883  hypothetical protein  58.21 
 
 
67 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2441  hypothetical protein  55.74 
 
 
70 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0994  hypothetical protein  52.24 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2690  hypothetical protein  55.56 
 
 
70 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3104  hypothetical protein  54.84 
 
 
70 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1445  hypothetical protein  54.84 
 
 
70 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000274385  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1457  hypothetical protein  54.84 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000515055  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1392  hypothetical protein  54.84 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  hitchhiker  0.000000000223509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2776  hypothetical protein  53.23 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2871  hypothetical protein  53.23 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.061034  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2796  hypothetical protein  53.23 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000387625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1582  hypothetical protein  53.23 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00572873  hitchhiker  0.000000000892194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2183  hypothetical protein  54.84 
 
 
71 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00725141  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1736  hypothetical protein  54.24 
 
 
62 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00537203 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1168  hypothetical protein  52.24 
 
 
67 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0485265  normal  0.126303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0244  hypothetical protein  51.56 
 
 
68 aa  72  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.373808  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2612  hypothetical protein  51.61 
 
 
72 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.263464  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0969  hypothetical protein  52.24 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0106427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2475  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250816  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1351  hypothetical protein  50.75 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00580499  hitchhiker  0.000123196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0208  rhodanese-related sulfurtransferase  47.76 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0587  hypothetical protein  52.46 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1091  hypothetical protein  49.25 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00223092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1346  hypothetical protein  50.75 
 
 
87 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1458  hypothetical protein  52.54 
 
 
76 aa  67  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3630  hypothetical protein  52.46 
 
 
61 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0492  hypothetical protein  52.24 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119962  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2179  hypothetical protein  48.44 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000190781  hitchhiker  0.00000346737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1411  hypothetical protein  45.9 
 
 
88 aa  62  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3849  hypothetical protein  46.67 
 
 
70 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1613  hypothetical protein  53.23 
 
 
72 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0675428  hitchhiker  0.00154974 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3933  hypothetical protein  46.67 
 
 
70 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0396  hypothetical protein  45 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191908  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000100  hypothetical protein  45.9 
 
 
61 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4226  hypothetical protein  46.67 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1175  hypothetical protein  41.79 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3564  hypothetical protein  42.65 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0710872  normal  0.0244929 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2741  hypothetical protein  42.62 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2350  hypothetical protein  40.3 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3124  hypothetical protein  41.67 
 
 
70 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2398  hypothetical protein  37.68 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3758  hypothetical protein  38.46 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3464  hypothetical protein  41.67 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000141728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3711  hypothetical protein  40.91 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3342  hypothetical protein  37.88 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00840593 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3768  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3851  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1998  hypothetical protein  42.65 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2365  hypothetical protein  42.65 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0057  hypothetical protein  37.93 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3301  thiosulfate sulfurtransferase  41.43 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.967077  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2829  hypothetical protein  37.5 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00164187  hitchhiker  0.00166345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3745  hypothetical protein  35.38 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  36.07 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1237  hypothetical protein  32.31 
 
 
69 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  39.66 
 
 
185 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>