77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4698 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4698  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  130  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0589  hypothetical protein  71.21 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.815479  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2242  hypothetical protein  71.21 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.373978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2690  hypothetical protein  73.77 
 
 		 70 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1582  hypothetical protein  72.58 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00572873  hitchhiker  0.000000000892194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2871  hypothetical protein  72.58 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.061034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2612  hypothetical protein  66.13 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.263464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2796  hypothetical protein  72.58 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000387625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2776  hypothetical protein  72.58 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1392  hypothetical protein  72.58 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  hitchhiker  0.000000000223509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1445  hypothetical protein  72.58 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000274385  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1457  hypothetical protein  72.58 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000515055  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1388  hypothetical protein  69.7 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.801628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2479  hypothetical protein  63.64 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3104  hypothetical protein  69.35 
 
 		 70 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2288  hypothetical protein  65.15 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2475  hypothetical protein  69.35 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2441  hypothetical protein  67.21 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1105  hypothetical protein  65.15 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2183  hypothetical protein  70.49 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00725141  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1411  hypothetical protein  67.21 
 
 		 88 aa  90.9  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158578  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1672  hypothetical protein  62.12 
 
 		 67 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.495158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0993  hypothetical protein  64.18 
 
 		 67 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.984074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1300  hypothetical protein  59.09 
 
 		 67 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.570889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0244  hypothetical protein  64.62 
 
 		 68 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.373808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0492  hypothetical protein  68.18 
 
 		 67 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119962  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3630  hypothetical protein  67.21 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0587  hypothetical protein  65.57 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4202  hypothetical protein  57.58 
 
 		 67 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4303  hypothetical protein  56.06 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000100  hypothetical protein  59.02 
 
 		 61 aa  77  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3721  hypothetical protein  62.12 
 
 		 67 aa  77  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1127  hypothetical protein  57.58 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.222198  normal  0.339922 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0994  hypothetical protein  60.61 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1168  hypothetical protein  54.55 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0485265  normal  0.126303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3564  hypothetical protein  60.29 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0710872  normal  0.0244929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3724  hypothetical protein  56.06 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0417243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1210  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  57.58 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0969  hypothetical protein  54.55 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0106427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0883  hypothetical protein  56.06 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1351  hypothetical protein  56.06 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00580499  hitchhiker  0.000123196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1346  hypothetical protein  51.52 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1736  hypothetical protein  61.02 
 
 		 62 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00537203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1613  hypothetical protein  62.3 
 
 		 72 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0675428  hitchhiker  0.00154974 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1091  hypothetical protein  56.06 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00223092  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0208  rhodanese-related sulfurtransferase  48.48 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3224  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3301  thiosulfate sulfurtransferase  55.71 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.967077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3768  hypothetical protein  53.03 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3851  hypothetical protein  53.03 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209751  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  45.45 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3711  hypothetical protein  53.03 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2179  hypothetical protein  51.56 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000190781  hitchhiker  0.00000346737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3758  hypothetical protein  49.32 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3342  hypothetical protein  51.52 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00840593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1458  hypothetical protein  55.93 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1175  hypothetical protein  51.52 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3849  hypothetical protein  46.67 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2398  hypothetical protein  45.07 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2741  hypothetical protein  54.1 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3933  hypothetical protein  46.67 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0057  hypothetical protein  49.15 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1998  hypothetical protein  54.41 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2365  hypothetical protein  54.41 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0396  hypothetical protein  46.67 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4226  hypothetical protein  46.67 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411224  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2350  hypothetical protein  46.27 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3124  hypothetical protein  46.67 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2829  hypothetical protein  51.67 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00164187  hitchhiker  0.00166345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3745  hypothetical protein  50.77 
 
 		 74 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1237  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3464  hypothetical protein  43.33 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000141728  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  37.93 
 
 		 175 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  37.7 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  42.59 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0520  hypothetical protein  47.37 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  37.93 
 
 		 190 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>