134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02180  ADP-ribosylglycohydrolase  100 
 
 
322 aa  633  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1428  ADP-ribosylation/Crystallin J1  35.76 
 
 
284 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1187  ADP-ribosylation/Crystallin J1  34.09 
 
 
300 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1782  ADP-ribosylation/crystallin J1  36.36 
 
 
306 aa  92.4  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.540626  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1769  ADP-ribosylation/crystallin J1  36.18 
 
 
306 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.568852  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0836  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.47 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0338  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.18 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3887  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.27 
 
 
262 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0426  ADP-ribosylation/Crystallin J1  32.64 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.97 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.65 
 
 
302 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23770  ADP-ribosylglycohydrolase  31.56 
 
 
279 aa  86.7  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2266  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.93 
 
 
256 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433893  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2793  ADP-ribosylation/Crystallin J1  32.67 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0672  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.82 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.783902  normal  0.600342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1972  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.02 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14628  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.32 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2755  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.57 
 
 
273 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0488  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.13 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0929  ADP-ribosylglycohydrolase  31.39 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1495  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.22 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.944205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2212  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.29 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.127085  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1586  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.05 
 
 
253 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0746  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.97 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0067  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.09 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2428  ADP-ribosylation/Crystallin J1  31.16 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4641  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.91 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0289  ADP-ribosylglycohydrolase  26.84 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.43 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1884  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.12 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1877  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.12 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.251448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2034  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.88 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0450812  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0150  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.9 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6286  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.92 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000874505  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1468  ADP-ribosylglycohydrolase  25.46 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1562  ADP-ribosylglycohydrolase-like  28 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000180951  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4684  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.89 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4025  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.89 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0950  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.62 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5360  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.02 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.277365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02027  predicted hydrolase  28.12 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2175  ADP-ribosylation/Crystallin J1  31 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00127122  hitchhiker  0.00000523394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0737  ADP-ribosylation/Crystallin J1  34.02 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01991  hypothetical protein  28.12 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0460  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.62 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2387  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.32 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1558  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.12 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1548  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.12 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64096  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0965  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  27.83 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3565  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.99 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1139  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  27.83 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.130877  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4210  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.91 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2235  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  27.83 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3078  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.02 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0571365 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2218  ADP-ribosylglycohydrolase, putative  26.32 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0784925  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1306  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2183  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.37 
 
 
260 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0325  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.01 
 
 
320 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00576959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0739  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.16 
 
 
308 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1683  ADP-ribosylation/Crystallin J1  36.21 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0526247  hitchhiker  0.0000264374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5543  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.35 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0397  ADP-ribosylglycohydrolase  26.27 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3893  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.75 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4406  ADP-ribosylation/Crystallin J1  31.02 
 
 
463 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0255559  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1670  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.71 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.820356  normal  0.114795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3310  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.11 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0157  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.08 
 
 
361 aa  59.3  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0831  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.13 
 
 
698 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0849  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.13 
 
 
698 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2800  dinitrogenase reductase activating glycohydrolase  26.4 
 
 
309 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0849  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.69 
 
 
701 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495566  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0024  ADP-ribosylation/Crystallin J1  32.14 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1638  hypothetical protein  25.87 
 
 
290 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4607  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.38 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916055  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5053  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.48 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.962607  normal  0.612081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2379  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  25.83 
 
 
334 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.376098  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1731  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.22 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1603  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.57 
 
 
363 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1100  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.37 
 
 
483 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0057  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.71 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2330  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  26.36 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2375  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  26.36 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03415  ADP-ribosylglycohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01570)  24.85 
 
 
329 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00015397  normal  0.493778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2487  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  26.36 
 
 
334 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2286  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  25.83 
 
 
334 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3202  hypothetical protein  29.28 
 
 
294 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.53 
 
 
508 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2658  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.6 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04620  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.19 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4137  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.43 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782037  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2268  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.62 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1000  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.53 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.945503  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3689  ADP-ribosylation/Crystallin J1  32.09 
 
 
467 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11130  ADP-ribosylglycohydrolase  26.44 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.11058 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0374  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.63 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0420  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.99 
 
 
301 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1446  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.51 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00190171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04650  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.67 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01599  dinitrogenase reductase activationg glycohydrolase  28.12 
 
 
286 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1642  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.92 
 
 
392 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000640129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>