154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2428 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2428  ADP-ribosylation/Crystallin J1  100 
 
 
335 aa  663    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0488  ADP-ribosylation/crystallin J1  34.64 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.44 
 
 
302 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.25 
 
 
302 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2218  ADP-ribosylglycohydrolase, putative  27.98 
 
 
328 aa  106  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0784925  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1495  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.81 
 
 
302 aa  106  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.944205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.43 
 
 
302 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3606  ADP-ribosylation/Crystallin J1  32.18 
 
 
358 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3310  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.21 
 
 
333 aa  96.7  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1000  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.03 
 
 
333 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.945503  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0289  ADP-ribosylglycohydrolase  28.45 
 
 
347 aa  95.1  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1468  ADP-ribosylglycohydrolase  25.76 
 
 
332 aa  94.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2379  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  30.72 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.376098  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2286  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  30.72 
 
 
334 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2487  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  30.42 
 
 
334 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2330  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  30.72 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2375  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  30.72 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3565  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.82 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0397  ADP-ribosylglycohydrolase  27.74 
 
 
315 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3078  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.45 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0571365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0965  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.74 
 
 
334 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2387  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.45 
 
 
334 aa  89  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02027  predicted hydrolase  28.45 
 
 
334 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1558  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.45 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01991  hypothetical protein  28.45 
 
 
334 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2235  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.45 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1548  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.45 
 
 
334 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64096  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1139  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.45 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.130877  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1600  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.93 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000152674  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0157  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.46 
 
 
361 aa  87.4  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0325  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.06 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00576959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4137  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.06 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782037  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2285  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.75 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18040  ADP-ribosylglycohydrolase  32.51 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992393  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4641  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.29 
 
 
335 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1446  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.62 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00190171  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0076  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.25 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5053  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.84 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.962607  normal  0.612081 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1562  ADP-ribosylglycohydrolase-like  25.91 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000180951  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2921  ADP-ribosylglycohydrolase  29.53 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6466  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.05 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4210  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.36 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0950  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.23 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  30 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7808  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.28 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5543  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.09 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1958  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.47 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667193  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1008  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.61 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4607  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.83 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916055  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3893  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.71 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.49 
 
 
539 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0150  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.04 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1187  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.83 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03415  ADP-ribosylglycohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01570)  27.33 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00015397  normal  0.493778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4025  ADP-ribosylation/Crystallin J1  21.71 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0877  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.66 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2793  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.65 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1877  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.38 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.251448  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0739  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.15 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.71 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  25.71 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0338  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.57 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6695  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.38 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0746  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.26 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4610  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.45 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.383385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2490  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.3 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.360174  normal  0.126045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2093  ADP-ribosylglycohydrolase  24.31 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0441  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.95 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1972  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.9 
 
 
262 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1782  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.62 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.540626  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1208  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.35 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0350047  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4684  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.03 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0680  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.06 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.782258  normal  0.702569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.53 
 
 
1138 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02180  ADP-ribosylglycohydrolase  31.07 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5360  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.93 
 
 
632 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.277365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2136  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.75 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0426  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.46 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1447  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.82 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1603  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.41 
 
 
363 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1302  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.29 
 
 
372 aa  59.7  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3462  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.4 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2658  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.97 
 
 
296 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3202  hypothetical protein  28.53 
 
 
294 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2800  dinitrogenase reductase activating glycohydrolase  26.14 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2294  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.85 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259278  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0067  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.19 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2266  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.56 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1428  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.62 
 
 
284 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0383  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.45 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2082  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.74 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1210  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.87 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0331208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0737  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.52 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4396  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  24.85 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2942  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.96 
 
 
299 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.220278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0165  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.98 
 
 
306 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.697838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1100  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.22 
 
 
483 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4284  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  24.85 
 
 
346 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4465  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  24.85 
 
 
346 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4313  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  24.54 
 
 
346 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>