141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2218 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2218  ADP-ribosylglycohydrolase, putative  100 
 
 
328 aa  673    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0784925  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1468  ADP-ribosylglycohydrolase  51.4 
 
 
332 aa  326  3e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0157  ADP-ribosylation/crystallin J1  47.87 
 
 
361 aa  296  4e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3078  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  43.69 
 
 
334 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0571365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2387  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  43.38 
 
 
334 aa  278  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02027  predicted hydrolase  43.38 
 
 
334 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1558  ADP-ribosylation/Crystallin J1  43.38 
 
 
334 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01991  hypothetical protein  43.38 
 
 
334 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0965  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  43.38 
 
 
334 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1139  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  43.38 
 
 
334 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.130877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2235  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  43.38 
 
 
334 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1548  ADP-ribosylation/crystallin J1  43.38 
 
 
334 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64096  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1000  ADP-ribosylation/Crystallin J1  44.72 
 
 
333 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.945503  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3310  ADP-ribosylation/Crystallin J1  44.41 
 
 
333 aa  275  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2487  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  45.17 
 
 
334 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2286  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  44.55 
 
 
334 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2330  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  44.55 
 
 
334 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2375  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  44.55 
 
 
334 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2379  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  44.24 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.376098  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3606  ADP-ribosylation/Crystallin J1  40 
 
 
358 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2285  ADP-ribosylation/Crystallin J1  33.12 
 
 
333 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0289  ADP-ribosylglycohydrolase  33.86 
 
 
347 aa  152  8.999999999999999e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4137  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.73 
 
 
332 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782037  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2921  ADP-ribosylglycohydrolase  30.31 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.15 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.79 
 
 
302 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0441  ADP-ribosylation/Crystallin J1  32.56 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.82 
 
 
302 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18040  ADP-ribosylglycohydrolase  29.14 
 
 
342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992393  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1495  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.11 
 
 
302 aa  126  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.944205  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0488  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.26 
 
 
319 aa  113  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4313  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  30.32 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4398  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  30.03 
 
 
346 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4284  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  30.03 
 
 
346 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4465  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  30.03 
 
 
346 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4396  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  29.74 
 
 
346 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2428  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.07 
 
 
335 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15150  ADP-ribosylglycohydrolase  30.23 
 
 
355 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275445  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0746  ADP-ribosylation/crystallin J1  25 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1446  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  22.26 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00190171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0397  ADP-ribosylglycohydrolase  27.11 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0150  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.48 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1562  ADP-ribosylglycohydrolase-like  25.08 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000180951  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4610  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.92 
 
 
304 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.383385  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.8 
 
 
505 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2793  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.69 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3565  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.3 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0338  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.68 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4025  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.16 
 
 
386 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0325  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.36 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00576959  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1600  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.62 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000152674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0739  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.3 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2490  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.32 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.360174  normal  0.126045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.1 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2800  dinitrogenase reductase activating glycohydrolase  23.15 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0877  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  22.84 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0420  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.53 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156753  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0950  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.92 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2755  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.01 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1603  ADP-ribosylation/Crystallin J1  20.91 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1008  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.19 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2093  ADP-ribosylglycohydrolase  24.17 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4684  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  22.89 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3018  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.36 
 
 
366 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04620  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.33 
 
 
329 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0165  ADP-ribosylation/Crystallin J1  23.53 
 
 
306 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.697838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3893  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.78 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1731  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.61 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4607  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.77 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916055  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4977  ADP-ribosylglycohydrolase  24.6 
 
 
336 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1447  ADP-ribosylation/crystallin J1  24 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1073  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.32 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.15 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1210  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.65 
 
 
317 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0331208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5053  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.38 
 
 
313 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.962607  normal  0.612081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0680  ADP-ribosylation/crystallin J1  20.99 
 
 
300 aa  59.3  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.782258  normal  0.702569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.75 
 
 
490 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3462  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  21.41 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2658  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  22.19 
 
 
296 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0383  ADP-ribosylation/Crystallin J1  22.56 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3202  hypothetical protein  23.89 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11130  ADP-ribosylglycohydrolase  21.66 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.11058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.15 
 
 
508 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4210  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.16 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7808  ADP-ribosylation/crystallin J1  20.9 
 
 
371 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6466  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.01 
 
 
368 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0831  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.16 
 
 
698 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0849  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.16 
 
 
698 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5181  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.15 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4641  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.66 
 
 
335 aa  56.2  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.55 
 
 
1138 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0849  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.38 
 
 
701 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495566  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0426  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.07 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0076  ADP-ribosylation/Crystallin J1  21.17 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1100  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.52 
 
 
483 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2513  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  22.4 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2266  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.43 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2761  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.27 
 
 
371 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79492  normal  0.771767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1208  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  21 
 
 
343 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0350047  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6286  ADP-ribosylation/Crystallin J1  22.5 
 
 
301 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000874505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>