149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0289 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0289  ADP-ribosylglycohydrolase  100 
 
 
347 aa  715    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2921  ADP-ribosylglycohydrolase  47 
 
 
337 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18040  ADP-ribosylglycohydrolase  45.26 
 
 
342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992393  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4137  ADP-ribosylation/crystallin J1  43.7 
 
 
332 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782037  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15150  ADP-ribosylglycohydrolase  45.64 
 
 
355 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275445  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2285  ADP-ribosylation/Crystallin J1  37.39 
 
 
333 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0157  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.44 
 
 
361 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2218  ADP-ribosylglycohydrolase, putative  33.86 
 
 
328 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0784925  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1468  ADP-ribosylglycohydrolase  31.29 
 
 
332 aa  142  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3606  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.22 
 
 
358 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3078  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  29.3 
 
 
334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0571365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1139  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.98 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.130877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3310  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.34 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2235  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.98 
 
 
334 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02027  predicted hydrolase  28.66 
 
 
334 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1558  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.66 
 
 
334 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01991  hypothetical protein  28.66 
 
 
334 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2387  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.66 
 
 
334 aa  126  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0965  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.66 
 
 
334 aa  126  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1548  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.66 
 
 
334 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64096  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1000  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.34 
 
 
333 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.945503  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0441  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.73 
 
 
344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0488  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.1 
 
 
319 aa  109  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2330  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.03 
 
 
334 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2375  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.03 
 
 
334 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2487  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  28.06 
 
 
334 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2286  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  27.71 
 
 
334 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2379  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  27.71 
 
 
334 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.376098  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2428  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.27 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.25 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1495  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.15 
 
 
302 aa  89.4  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.944205  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.52 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.43 
 
 
302 aa  86.3  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4210  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.62 
 
 
331 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0397  ADP-ribosylglycohydrolase  27.69 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2793  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.71 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.46 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4641  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.65 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4607  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.03 
 
 
360 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916055  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04650  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.56 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2136  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.1 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382928 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04620  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.12 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3893  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.77 
 
 
306 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1731  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.92 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4398  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  24.18 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0746  ADP-ribosylation/crystallin J1  24 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4284  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  24.18 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4313  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  24.18 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4465  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  24.18 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1600  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.85 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000152674  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1562  ADP-ribosylglycohydrolase-like  25.95 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000180951  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2082  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.14 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0680  ADP-ribosylation/crystallin J1  25 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.782258  normal  0.702569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4396  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  23.88 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2490  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.25 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.360174  normal  0.126045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.91 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1670  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.69 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.820356  normal  0.114795 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.21 
 
 
462 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  24.21 
 
 
462 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4684  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.08 
 
 
314 aa  67  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0950  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.06 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2369  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.52 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120569  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1447  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.55 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.42 
 
 
505 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0420  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.56 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5543  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.59 
 
 
333 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4977  ADP-ribosylglycohydrolase  23.55 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1208  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.22 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0350047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4610  ADP-ribosylation/crystallin J1  25 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.383385  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3565  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.22 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2800  dinitrogenase reductase activating glycohydrolase  23.78 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0067  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.98 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7808  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.88 
 
 
371 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0057  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.92 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6466  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.76 
 
 
368 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0150  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.64 
 
 
301 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0165  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.92 
 
 
306 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.697838  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3462  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.01 
 
 
301 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0383  ADP-ribosylation/Crystallin J1  23.21 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.48 
 
 
490 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3018  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.8 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1302  ADP-ribosylation/Crystallin J1  23.57 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2513  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.56 
 
 
371 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5360  ADP-ribosylation/Crystallin J1  21.95 
 
 
632 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.277365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0825  putative ribosylglycohydrolase  24.21 
 
 
331 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.435184  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1472  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.8 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02180  ADP-ribosylglycohydrolase  26.43 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0374  ADP-ribosylation/Crystallin J1  23.44 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5053  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.58 
 
 
313 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.962607  normal  0.612081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1073  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  22.83 
 
 
355 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0076  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.92 
 
 
309 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1877  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.23 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.251448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1306  beta-lactamase domain-containing protein  23.77 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6185  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.93 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1958  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.63 
 
 
270 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667193  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0338  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  22.82 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0325  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.17 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00576959  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3365  ADP-ribosylation/Crystallin J1  23.36 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  hitchhiker  0.000474604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3034  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.8 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0024  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.65 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>