96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2942 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2942  ADP-ribosylation/crystallin J1  100 
 
 
299 aa  592  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.220278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1603  ADP-ribosylation/Crystallin J1  52.56 
 
 
363 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6185  ADP-ribosylation/Crystallin J1  46.89 
 
 
385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7808  ADP-ribosylation/crystallin J1  48.74 
 
 
371 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  44.15 
 
 
539 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0924  putative ADP-ribosylglycohydrolase  46.43 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.897413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2576  ADP-ribosylation/crystallin J1  42.24 
 
 
376 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0795204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2308  ADP-ribosylation/Crystallin J1  43.75 
 
 
360 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000162775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6695  ADP-ribosylation/Crystallin J1  45.1 
 
 
348 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0384  ADP-ribosylation/Crystallin J1  38.91 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08400  ADP-ribosylglycohydrolase  38.35 
 
 
384 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.58132  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4210  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.61 
 
 
331 aa  92.8  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0397  ADP-ribosylglycohydrolase  30.32 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4641  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.25 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1877  ADP-ribosylation/Crystallin J1  34.4 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.251448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5543  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.45 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.65 
 
 
1138 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0076  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.54 
 
 
309 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4684  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.89 
 
 
314 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1446  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.23 
 
 
329 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00190171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0325  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.31 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00576959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1208  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.29 
 
 
343 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0350047  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3202  hypothetical protein  29.23 
 
 
294 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  29.86 
 
 
462 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.86 
 
 
462 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0680  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.3 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.782258  normal  0.702569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2268  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.77 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1958  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.8 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667193  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2428  ADP-ribosylation/Crystallin J1  31.96 
 
 
335 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1008  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.15 
 
 
294 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861843  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6286  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.72 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000874505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3018  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.13 
 
 
366 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3606  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.85 
 
 
358 aa  55.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2800  dinitrogenase reductase activating glycohydrolase  27.47 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2490  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.85 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.360174  normal  0.126045 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0150  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.47 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2082  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.52 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1670  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.39 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.820356  normal  0.114795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0420  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.15 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156753  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.84 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600884  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.71 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0488  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.69 
 
 
319 aa  52.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0739  ADP-ribosylation/Crystallin J1  22.28 
 
 
308 aa  52.8  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.21 
 
 
490 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2793  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.34 
 
 
308 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0165  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.69 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.697838  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1302  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.86 
 
 
372 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1210  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.27 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0331208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5053  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.28 
 
 
313 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.962607  normal  0.612081 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0950  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.65 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.78 
 
 
505 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1600  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.55 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000152674  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.91 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2093  ADP-ribosylglycohydrolase  25 
 
 
307 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1638  hypothetical protein  28.93 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2658  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.23 
 
 
296 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2136  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.7 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382928 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1562  ADP-ribosylglycohydrolase-like  28.26 
 
 
298 aa  49.7  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000180951  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.65 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0057  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.06 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1495  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.3 
 
 
302 aa  49.3  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.944205  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5360  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.81 
 
 
632 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.277365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3462  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.27 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03415  ADP-ribosylglycohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01570)  26.85 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00015397  normal  0.493778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1322  ADP-ribosylglycohydrolase  40.28 
 
 
86 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0067  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.47 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4610  ADP-ribosylation/crystallin J1  34.57 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.383385  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1000  ADP-ribosylation/Crystallin J1  32.22 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.945503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0024  ADP-ribosylation/Crystallin J1  23.81 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2362  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.63 
 
 
331 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00145614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3310  ADP-ribosylation/Crystallin J1  31.67 
 
 
333 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0108  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.72 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1073  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.24 
 
 
355 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3893  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.77 
 
 
306 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2285  ADP-ribosylation/Crystallin J1  39.47 
 
 
333 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6466  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.96 
 
 
368 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.09 
 
 
307 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1548  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.84 
 
 
334 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64096  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2387  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  27.84 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0825  putative ribosylglycohydrolase  28.42 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.435184  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3078  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  30.51 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0571365 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1558  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.84 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02027  predicted hydrolase  27.84 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01991  hypothetical protein  27.84 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0965  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  27.84 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0374  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.17 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2235  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  30.51 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.16 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  39.66 
 
 
508 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2513  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.34 
 
 
371 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3565  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  31.65 
 
 
330 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2408  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.72 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  normal  0.0934858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0746  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.73 
 
 
312 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46136  predicted protein  32.23 
 
 
719 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2294  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.32 
 
 
383 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259278  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1139  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  27.27 
 
 
334 aa  42.7  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.130877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>