42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0384 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0384  ADP-ribosylation/Crystallin J1  100 
 
 
345 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  38.6 
 
 
539 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7808  ADP-ribosylation/crystallin J1  40 
 
 
371 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6185  ADP-ribosylation/Crystallin J1  40.06 
 
 
385 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0924  putative ADP-ribosylglycohydrolase  46.44 
 
 
379 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.897413  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1603  ADP-ribosylation/Crystallin J1  40.62 
 
 
363 aa  176  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2576  ADP-ribosylation/crystallin J1  37.64 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0795204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2308  ADP-ribosylation/Crystallin J1  37.22 
 
 
360 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000162775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2942  ADP-ribosylation/crystallin J1  38.91 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.220278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6695  ADP-ribosylation/Crystallin J1  34.36 
 
 
348 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4210  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.46 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4641  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.64 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1877  ADP-ribosylation/Crystallin J1  31.83 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.251448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0397  ADP-ribosylglycohydrolase  28.85 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5543  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.74 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0488  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.41 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1446  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.19 
 
 
329 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00190171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2800  dinitrogenase reductase activating glycohydrolase  25.66 
 
 
309 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0150  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.88 
 
 
301 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0165  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.67 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.697838  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0420  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.77 
 
 
301 aa  53.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1208  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  22.16 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0350047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3565  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  22.35 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0338  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.15 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0877  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.85 
 
 
295 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0325  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.43 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00576959  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5053  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.25 
 
 
313 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.962607  normal  0.612081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0680  ADP-ribosylation/crystallin J1  24 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.782258  normal  0.702569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.25 
 
 
322 aa  49.7  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1210  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  22.78 
 
 
317 aa  49.7  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0331208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1670  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.7 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.820356  normal  0.114795 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3462  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  22.84 
 
 
301 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1562  ADP-ribosylglycohydrolase-like  23.74 
 
 
298 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000180951  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3043  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.31 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1447  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.88 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6286  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.47 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000874505  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2658  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.71 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0289  ADP-ribosylglycohydrolase  24.92 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  55 
 
 
490 aa  43.5  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  51.35 
 
 
772 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2082  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.19 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2136  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.31 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>