115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1428 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1428  ADP-ribosylation/Crystallin J1  100 
 
 
284 aa  560  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1769  ADP-ribosylation/crystallin J1  53.98 
 
 
306 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.568852  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1782  ADP-ribosylation/crystallin J1  53.29 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.540626  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0426  ADP-ribosylation/Crystallin J1  44.7 
 
 
321 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0737  ADP-ribosylation/Crystallin J1  50.35 
 
 
372 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1187  ADP-ribosylation/Crystallin J1  45.67 
 
 
300 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2175  ADP-ribosylation/Crystallin J1  47.78 
 
 
313 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00127122  hitchhiker  0.00000523394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1884  ADP-ribosylation/Crystallin J1  40.2 
 
 
311 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3413  ADP-ribosylation/crystallin J1  39.19 
 
 
306 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02180  ADP-ribosylglycohydrolase  36.23 
 
 
322 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0397  ADP-ribosylglycohydrolase  27.31 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1586  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.33 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0836  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.14 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0672  ADP-ribosylation/Crystallin J1  40.54 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.783902  normal  0.600342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3887  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.97 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2034  ADP-ribosylation/Crystallin J1  36.49 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0929  ADP-ribosylglycohydrolase  36.69 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2755  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.8 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2183  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.09 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1100  ADP-ribosylation/crystallin J1  33 
 
 
483 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2266  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.28 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02027  predicted hydrolase  25.84 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01991  hypothetical protein  25.84 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.15 
 
 
322 aa  65.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1558  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.84 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2387  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  25.84 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0965  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  25.84 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2212  ADP-ribosylation/Crystallin J1  34.42 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.127085  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1000  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.67 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.945503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0831  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.76 
 
 
698 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0849  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.76 
 
 
698 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1972  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.85 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2235  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  25.67 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3078  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  25.5 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0571365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0849  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.3 
 
 
701 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495566  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1139  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  25.5 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.130877  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2793  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.99 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.03 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6286  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.96 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000874505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6466  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.05 
 
 
368 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0165  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.11 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.697838  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.71 
 
 
302 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1548  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.33 
 
 
334 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64096  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.4 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23770  ADP-ribosylglycohydrolase  29.18 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0460  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.37 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0157  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.51 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01599  dinitrogenase reductase activationg glycohydrolase  31.16 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3310  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.67 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3893  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.12 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5181  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.19 
 
 
318 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1495  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.66 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.944205  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1731  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.92 
 
 
308 aa  58.9  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5053  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.48 
 
 
313 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.962607  normal  0.612081 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1468  ADP-ribosylglycohydrolase  23.1 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0423  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.53 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0811262  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2218  ADP-ribosylglycohydrolase, putative  26.57 
 
 
328 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0784925  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1562  ADP-ribosylglycohydrolase-like  27.68 
 
 
298 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000180951  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.68 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4684  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.43 
 
 
314 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0150  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.25 
 
 
301 aa  55.8  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3689  ADP-ribosylation/Crystallin J1  32.65 
 
 
467 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2093  ADP-ribosylglycohydrolase  27.53 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0057  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.35 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2428  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.94 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4607  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.08 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916055  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.81 
 
 
490 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4610  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.82 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.383385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2490  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.27 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.360174  normal  0.126045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3606  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.7 
 
 
358 aa  52.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0338  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.61 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4641  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.8 
 
 
335 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2379  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  24.69 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.376098  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2800  dinitrogenase reductase activating glycohydrolase  27.09 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0325  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.09 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00576959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2330  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  23.99 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2375  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  23.99 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2286  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  23.99 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0024  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.94 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.01 
 
 
505 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.58 
 
 
1138 aa  49.7  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2268  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.05 
 
 
329 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2513  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.57 
 
 
371 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2487  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  23.68 
 
 
334 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1683  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.46 
 
 
344 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0526247  hitchhiker  0.0000264374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1906  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.58 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000126129  hitchhiker  0.00160091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1073  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.95 
 
 
355 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0076  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.88 
 
 
309 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0383  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.04 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4210  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.94 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0746  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.79 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0035  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.97 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.378473  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1105  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.05 
 
 
484 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1302  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.42 
 
 
372 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2761  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.17 
 
 
371 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79492  normal  0.771767 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2285  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.74 
 
 
333 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2362  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.45 
 
 
331 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3018  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.89 
 
 
366 aa  45.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0825  putative ribosylglycohydrolase  25.74 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.435184  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1208  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.91 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0350047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>