110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2034 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2034  ADP-ribosylation/Crystallin J1  100 
 
 
273 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0450812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2183  ADP-ribosylation/Crystallin J1  94.59 
 
 
260 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1972  ADP-ribosylation/crystallin J1  63.78 
 
 
262 aa  347  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2212  ADP-ribosylation/Crystallin J1  57.77 
 
 
256 aa  310  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.127085  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0929  ADP-ribosylglycohydrolase  58.8 
 
 
261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2755  ADP-ribosylation/crystallin J1  52.83 
 
 
273 aa  298  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3887  ADP-ribosylation/crystallin J1  55.38 
 
 
262 aa  294  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0836  ADP-ribosylation/Crystallin J1  54.51 
 
 
268 aa  294  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2266  ADP-ribosylation/Crystallin J1  53.2 
 
 
256 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1586  ADP-ribosylation/crystallin J1  54.8 
 
 
253 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0672  ADP-ribosylation/Crystallin J1  54.4 
 
 
264 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.783902  normal  0.600342 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23770  ADP-ribosylglycohydrolase  51.06 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0423  ADP-ribosylation/crystallin J1  43.11 
 
 
253 aa  185  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0811262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0426  ADP-ribosylation/Crystallin J1  35.9 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1906  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.57 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000126129  hitchhiker  0.00160091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5053  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.79 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.962607  normal  0.612081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1073  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.84 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.19 
 
 
1138 aa  70.1  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3893  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.01 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1562  ADP-ribosylglycohydrolase-like  27.75 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000180951  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0057  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.69 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2362  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.66 
 
 
331 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4610  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.99 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.383385  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1495  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.58 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.944205  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03415  ADP-ribosylglycohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01570)  29.35 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00015397  normal  0.493778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1428  ADP-ribosylation/Crystallin J1  36.49 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.04 
 
 
508 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.77 
 
 
302 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0165  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.2 
 
 
306 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.697838  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0680  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.12 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.782258  normal  0.702569 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4684  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.04 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715956 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.9 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0950  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.46 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2268  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.31 
 
 
329 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.14 
 
 
302 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02180  ADP-ribosylglycohydrolase  26.44 
 
 
322 aa  58.9  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4977  ADP-ribosylglycohydrolase  26.74 
 
 
336 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1208  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.56 
 
 
343 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0350047  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6286  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.2 
 
 
301 aa  58.9  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000874505  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3565  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.09 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.5 
 
 
490 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.09 
 
 
307 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1210  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.14 
 
 
317 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0331208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.87 
 
 
322 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4025  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.79 
 
 
386 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2513  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.43 
 
 
371 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2800  dinitrogenase reductase activating glycohydrolase  32.43 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2093  ADP-ribosylglycohydrolase  27.06 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4406  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.01 
 
 
463 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0255559  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.92 
 
 
539 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1187  ADP-ribosylation/Crystallin J1  33.14 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1446  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.21 
 
 
329 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00190171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1958  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.97 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667193  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0150  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.12 
 
 
301 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0024  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.16 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.57 
 
 
308 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600884  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3101  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  31.82 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.5852 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.62 
 
 
505 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0831  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.74 
 
 
698 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0488  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.19 
 
 
319 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0849  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.74 
 
 
698 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2761  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.84 
 
 
371 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79492  normal  0.771767 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2793  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.72 
 
 
308 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0076  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.51 
 
 
309 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3689  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.31 
 
 
467 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01599  dinitrogenase reductase activationg glycohydrolase  28.03 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11130  ADP-ribosylglycohydrolase  28.57 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.11058 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2490  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.12 
 
 
311 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.360174  normal  0.126045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0746  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.02 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1769  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.06 
 
 
306 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.568852  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.35 
 
 
462 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  23.35 
 
 
462 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0325  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.97 
 
 
320 aa  48.9  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00576959  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1306  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0397  ADP-ribosylglycohydrolase  25.71 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0849  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.83 
 
 
701 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495566  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1782  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.95 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.540626  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4210  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.33 
 
 
331 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0420  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.74 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156753  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0338  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.85 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2428  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.52 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2218  ADP-ribosylglycohydrolase, putative  29.44 
 
 
328 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0784925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0825  putative ribosylglycohydrolase  25.78 
 
 
331 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.435184  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3018  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25 
 
 
366 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0737  ADP-ribosylation/Crystallin J1  34.3 
 
 
372 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3462  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.47 
 
 
301 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0739  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.74 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1100  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.26 
 
 
483 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1447  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.05 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2136  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.78 
 
 
301 aa  45.4  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382928 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0460  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.81 
 
 
310 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2082  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  32.26 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3365  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.93 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  hitchhiker  0.000474604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4607  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.31 
 
 
360 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916055  normal  0.815767 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02027  predicted hydrolase  26.51 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1558  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.51 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2369  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.32 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120569  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1548  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.51 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64096  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0965  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  26.51 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01991  hypothetical protein  26.51 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>