88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3101 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3101  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2761  ADP-ribosylation/crystallin J1  90.46 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79492  normal  0.771767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2513  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  77.41 
 
 		 371 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4977  ADP-ribosylglycohydrolase  71.43 
 
 		 336 aa  343  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1073  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  70.17 
 
 		 355 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3018  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  56.9 
 
 		 366 aa  272  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4684  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  44.44 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715956 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6286  ADP-ribosylation/Crystallin J1  43.81 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000874505  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  43.58 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  40.79 
 
 		 508 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3893  ADP-ribosylation/crystallin J1  41.05 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  41.33 
 
 		 490 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2268  ADP-ribosylation/crystallin J1  38.36 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  44.74 
 
 		 505 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0057  ADP-ribosylation/crystallin J1  39.15 
 
 		 305 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01599  dinitrogenase reductase activationg glycohydrolase  39.82 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  37.87 
 
 		 1138 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  42.52 
 
 		 322 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4610  ADP-ribosylation/crystallin J1  37.56 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.383385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0165  ADP-ribosylation/Crystallin J1  37.23 
 
 		 306 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.697838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2490  ADP-ribosylation/Crystallin J1  35.17 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.360174  normal  0.126045 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1562  ADP-ribosylglycohydrolase-like  36.68 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000180951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2362  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.33 
 
 		 331 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00145614  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03415  ADP-ribosylglycohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01570)  32.42 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00015397  normal  0.493778 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0325  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.61 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00576959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0746  ADP-ribosylation/crystallin J1  29 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0076  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.85 
 
 		 309 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5053  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.72 
 
 		 313 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.962607  normal  0.612081 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4025  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.47 
 
 		 386 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0877  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.8 
 
 		 295 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3565  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.98 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0024  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.23 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11130  ADP-ribosylglycohydrolase  31.34 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.11058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1208  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.32 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0350047  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0739  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.31 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3365  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.25 
 
 		 308 aa  75.5  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  hitchhiker  0.000474604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1210  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.49 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0331208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0338  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.22 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2793  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.34 
 
 		 308 aa  72  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2800  dinitrogenase reductase activating glycohydrolase  26.7 
 
 		 309 aa  72  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1008  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.9 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.76 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600884  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.57 
 
 		 462 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  28.57 
 
 		 462 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2093  ADP-ribosylglycohydrolase  25.47 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1446  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00190171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0680  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.63 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.782258  normal  0.702569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2658  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.88 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0420  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.79 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156753  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3043  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.57 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1447  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.79 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3462  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.05 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3202  hypothetical protein  26.2 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2408  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.49 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  normal  0.0934858 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1731  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.8 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3034  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.4 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.5 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2266  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.24 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2082  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.21 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3689  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.96 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3887  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.44 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2183  ADP-ribosylation/Crystallin J1  33.11 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0763  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.23 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2212  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.87 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.127085  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2755  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.92 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4406  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.7 
 
 		 463 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0255559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.2 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1958  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.63 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667193  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0929  ADP-ribosylglycohydrolase  25.93 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2034  ADP-ribosylation/Crystallin J1  31.82 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0450812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1495  ADP-ribosylation/crystallin J1  19.31 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.944205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2136  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.88 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1972  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.5 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14628  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6466  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.98 
 
 		 368 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0397  ADP-ribosylglycohydrolase  23.74 
 
 		 315 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2576  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.2 
 
 		 376 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0795204  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  20.28 
 
 		 302 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1302  ADP-ribosylation/Crystallin J1  23.98 
 
 		 372 aa  48.9  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0488  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.8 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0836  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.88 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1306  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2294  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.58 
 
 		 383 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0950  ADP-ribosylation/Crystallin J1  23.27 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23770  ADP-ribosylglycohydrolase  26.39 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1586  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.27 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1468  ADP-ribosylglycohydrolase  25.77 
 
 		 332 aa  42.7  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5360  ADP-ribosylation/Crystallin J1  23.43 
 
 		 632 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.277365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7808  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.49 
 
 		 371 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>