78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3512 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3887  hypothetical protein  84.6 
 
 
409 aa  664    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.305747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3512  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  801    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2391  acetyltransferase  41.91 
 
 
404 aa  289  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  hitchhiker  0.00956926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1552  GCN5-related N-acetyltransferase  42.44 
 
 
413 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8857  hypothetical protein  41.16 
 
 
419 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2201  hypothetical protein  40.1 
 
 
421 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1858  hypothetical protein  43.12 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346316  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7318  acetyltransferase  41.08 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1107  hypothetical protein  41.33 
 
 
416 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80545  normal  0.383897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
412 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46132  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2102  acetyltransferase  39.15 
 
 
424 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1863  hypothetical protein  38.71 
 
 
421 aa  221  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165564  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3185  acetyltransferase  39.95 
 
 
420 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0548677  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1149  hypothetical protein  41.24 
 
 
400 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24490  predicted acetyltransferase  37.1 
 
 
439 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3568  GCN5-related N-acetyltransferase  37.68 
 
 
402 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2624  GCN5-related protein N-acetyltransferase  41.33 
 
 
432 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.407198  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6041  hypothetical protein  37.99 
 
 
379 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48783  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1376  GCN5-related protein N-acetyltransferase  37.99 
 
 
414 aa  172  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.005111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12444  hypothetical protein  39.63 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.439735  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0866  hypothetical protein  37.79 
 
 
401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2731  hypothetical protein  39.26 
 
 
399 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0949  acetyltransferase  33.67 
 
 
441 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2745  hypothetical protein  38.97 
 
 
399 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.834944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2701  hypothetical protein  38.97 
 
 
399 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1253  acetyltransferase  32.81 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1803  hypothetical protein  36.77 
 
 
438 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2218  acetyltransferase  39.84 
 
 
429 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21910  predicted acetyltransferase  32.78 
 
 
397 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0891512  normal  0.2522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2064  hypothetical protein  31.64 
 
 
429 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.037054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0834  hypothetical protein  34.62 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2333  hypothetical protein  35.73 
 
 
420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1779  hypothetical protein  32.51 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2256  hypothetical protein  32.26 
 
 
434 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000511116  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2972  hypothetical protein  36 
 
 
425 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2776  hypothetical protein  30.21 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05980  predicted acetyltransferase  31.72 
 
 
432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.307493 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11130  predicted acetyltransferase  32.76 
 
 
457 aa  89  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0216  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
392 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2441  GCN5-related N-acetyltransferase  23.22 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  22.28 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0587  acetyltransferase  19.83 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5250  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.527352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4977  GCN5-related N-acetyltransferase  24.08 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1535  acetyltransferase  25.58 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2672  acetyltransferase  21.49 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02810  Acetyltransferase  20.24 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.619157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2952  acetyltransferase  21.63 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2743  acetyltransferase  21.63 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.891678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2952  acetyltransferase, GNAT family  21.37 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.86247e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2693  acetyltransferase  20.61 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0434  hypothetical protein  26.67 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.611412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2285  acetyltransferase, GNAT family  22.1 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000496858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2993  acetyltransferase  21.43 
 
 
385 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0576195  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  24.8 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2955  acetyltransferase, GNAT family  21.07 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3530  hypothetical protein  23.73 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3575  GCN5-related N-acetyltransferase  25.63 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0414984 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2999  GNAT family acetyltransferase  20.66 
 
 
310 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000158264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0858  GCN5-related N-acetyltransferase  23.81 
 
 
390 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2745  GCN5-related N-acetyltransferase  19.83 
 
 
387 aa  53.9  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2112  hypothetical protein  24.8 
 
 
415 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607011  normal  0.41072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6114  acetyltransferase  25.88 
 
 
385 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0452  Eis, predicted acetyltransferase-like acetyltransferase  19.84 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0190133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07040  hypothetical protein  29.92 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2471  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2342  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2472  hypothetical protein  30.43 
 
 
304 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2398  hypothetical protein  27.17 
 
 
295 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2935  hypothetical protein  27.17 
 
 
294 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.565765  hitchhiker  0.000101442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2247  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000346334  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11640  predicted acetyltransferase  32.46 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.310129  normal  0.265932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2535  hypothetical protein  26.09 
 
 
294 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.136932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2190  hypothetical protein  26.09 
 
 
294 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2457  hypothetical protein  26.09 
 
 
294 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2441  hypothetical protein  26.09 
 
 
294 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.451246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2233  hypothetical protein  26.09 
 
 
294 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000117919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2273  hypothetical protein  26.09 
 
 
294 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>